燃料電池的應用領域非常廣泛，目前主流發展的應用產品，依據燃料電池發電量歸類，可分為定置型發電機、各式運輸工具及可攜式電子產品三大類。
定置型
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中興電工機械(股)公司ME2Power燃料電池系統
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工業技術研究院SOFC系統
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美菲德(股)公司MF-UEH型蓄電燃料電池系統
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鼎佳能源(股)公司燃料電池發電系統
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鐙鋒綠能科技(股)公司mGen醇氫發電機
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高力熱處理工業(股)公司燃料電池系統
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運輸型
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博研燃料電池(股)公司燃料電池機車
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光陽工業(股)公司燃料電池機車
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雷虎科技(股)公司長滯空氫燃料電動無人機
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亞太燃料電池科技(股)公司燃料電池機車
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錫力科技(股)公司燃料電池遊輪
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工業技術研究院/田屋科技有限公司無人機
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可攜式型
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工業技術研究院可攜式發電機
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工業技術研究院手機充電器
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